游戲開(kāi)始于余杭鎮(zhèn)一個(gè)小客棧。南盜俠夫婦之子李逍遙在客棧內(nèi)趕走一個(gè)乞酒喝的破道士并約定在十里坡傳授劍術(shù)后，嬸嬸突然患病昏迷。為治嬸嬸的病，他欲上仙靈島求仙藥，得到3個(gè)苗人贈(zèng)與的破天錘，并喝下忘憂散。
來(lái)到仙靈島用破天錘打碎修羅石像后，懈逅正在沐浴的少女趙靈兒，并取得靈藥。無(wú)奈靈兒姥姥回來(lái)，誤認(rèn)為逍遙欺負(fù)靈兒，逼迫二人成親。逍遙為救嬸嬸，清晨拿著仙藥紫金丹離開(kāi)。嬸嬸蘇醒后逍遙先前所服望憂散發(fā)作，失去了從仙靈島拿藥回來(lái)的全部記憶。
半夜去十里坡學(xué)劍回來(lái)，在客棧二樓見(jiàn)到被綁架的靈兒，二人同回仙靈島，發(fā)現(xiàn)姥姥已死。李逍遙的嬸嬸得知二人已成親后，令逍遙帶靈兒去黑苗找她母親（巫后）。二人搭順風(fēng)船來(lái)到蘇州。
在蘇州城門外，二人遇見(jiàn)刁蠻少女林月如。李逍遙為救一對(duì)私奔男女打敗月如，將其綁于樹(shù)上。后月如遇到流氓襲擊，逍遙靈兒救她后，她為面子將逍遙刺傷后逃竄。靈兒拼死用還魂咒救活逍遙，二人進(jìn)城。
進(jìn)城后在一間客棧內(nèi)救出被群毆的書(shū)生劉晉元，逍遙與他長(zhǎng)談一夜，以為知己，早晨陪靈兒去玩，碰見(jiàn)月如比武招親，逍遙上擂臺(tái)打敗她后被要求入贅林家。
劉晉元（月如表哥）和逍遙堅(jiān)決反對(duì)。半夜,，靈兒女?huà)z后人的特征顯露出來(lái)（現(xiàn)出蛇身），不知實(shí)情的逍遙以為靈兒被蛇妖擄走，和月如一起追至隱龍窟。
殺掉隱龍窟里的蛇妖男和狐妖女后沒(méi)有靈兒的下落。二人遂放出里面的一群少女，并來(lái)到小鎮(zhèn)擺到桌面上白河村。在村長(zhǎng)兼大夫韓醫(yī)仙家遇見(jiàn)靈兒。
此時(shí)她已懷有身孕，但因不想逍遙知道且身體虛弱而假裝昏迷。逍遙與月如分頭取藥將她治好。三人為報(bào)答韓醫(yī)仙除掉了一個(gè)佛珠幻化的和尚和黑水鎮(zhèn)的尸妖（獲得土靈珠）?；貋?lái)后發(fā)現(xiàn)韓醫(yī)仙女兒被苗人擄走，于是來(lái)到鬼陰山。靈兒為救其他兩人跟隨苗人石長(zhǎng)老離開(kāi)。
了解了黑苗教主拜月想要訓(xùn)練水魔獸以統(tǒng)治苗人的陰謀，巫后與水魔獸同歸于盡后，逍遙幫助她的侍女（靈兒的姥姥）將小時(shí)的靈兒送到仙靈島并與小時(shí)的逍遙換的水靈珠后回到現(xiàn)實(shí)。二人幫助桃花村的桃樹(shù)精們打敗了妖怪，找全了36個(gè)傀儡蟲(chóng)。
穿過(guò)地底通道到達(dá)地底王宮。從地底王宮進(jìn)入王宮大殿，看到巫王獨(dú)自坐在王座上，巫王要將王位讓給靈兒，并原諒他的行為。話沒(méi)說(shuō)完拜月教主就出來(lái)制止。李逍遙打敗他派出的殿前武士，巫王突然偷襲靈兒，使她受了重傷。
原來(lái)巫王早已被拜月教主害死，這個(gè)巫王是妖怪喬裝而成。李逍遙和阿奴殺掉這個(gè)裝扮成巫王的妖怪后，阿奴留下來(lái)為靈兒療傷，李逍遙則在王宮入口處追上拜月教主。拜月教主承認(rèn)水災(zāi)和旱災(zāi)均是他一手操縱，他要率領(lǐng)魔獸征服天下。
這時(shí)靈兒和阿奴也趕到，三人合力將拜月教主打倒。拜月教主投水，與水魔獸合體，引發(fā)大水，將李逍遙和阿奴沖走，只有靈兒飛身上前與水魔獸決戰(zhàn)。
魔獸消失了大水也退了，但靈兒不再出現(xiàn)。不久李逍遙與阿奴告別，獨(dú)自離開(kāi)了苗疆。阿奴送走了逍遙，也送走了她的心。月如得圣姑以傀儡蟲(chóng)復(fù)生，抱著初生的憶如，等待李逍遙和靈兒歸來(lái)。
擴(kuò)展資料：
相對(duì)于DOS版
1、98柔情篇改變了DOS版中使用靜態(tài)圖片的方式，添加片頭，片尾動(dòng)畫(huà)。格式為AⅥ，只有在Windows95/98下運(yùn)行游戲才能正常觀看。
（2006年玩家louyihua(SuperMouse）制作了在WindowsXP/2003下完美觀看動(dòng)畫(huà)的補(bǔ)丁。）
2、98柔情篇改用單一音樂(lè)格式：在DOS版中，根據(jù)用戶配置的不同，背景音樂(lè)采用RⅨ格式（一種FM音樂(lè)格式）或者是MIDI格式；而在98版中則只用MIDI格式。
（2006年玩家louyihua(SuperMouse）制作了在98柔情篇中使用RⅨ格式音樂(lè)的補(bǔ)丁。）
3、98柔情篇重新制作音效。
4、若干場(chǎng)景被修改。例如：98版中進(jìn)仙靈島的道路加了一塊巨石以遮擋視線；98版比武招親時(shí)多加了許多觀眾；98版白河村的木橋變成了石橋。
5、若干迷宮地圖被簡(jiǎn)化。被簡(jiǎn)化的地圖包括：隱龍窟、將軍冢、血池、鬼陰山、蛤蟆洞后洞、神木林、火眼麒麟洞、無(wú)底深淵。
