人類補(bǔ)完計劃在動畫片中卻始終沒有給出明確的答案。

比較通行的觀點是：人類（無論是肉體還是心靈）都是由脆弱的物質(zhì)構(gòu)成的，所以也就非常容易受到傷害，而在人與人之間，心靈的世界是彼此隔絕的，要使人類向更高的領(lǐng)域進(jìn)化，就必須使人的心靈擺脫軀體的束縛，重新回到人類的誕生之地“莉莉絲之卵”中。

唯有如此才能最終拆除人與人之間的心靈屏障，使不同的心靈世界能夠相互補(bǔ)充，走向進(jìn)化的終點——成為永生的“神”。人類補(bǔ)完計劃就是為了實現(xiàn)這個神圣目的而創(chuàng)立的。

《新世紀(jì)福音戰(zhàn)士》劇情介紹：

故事描述的是一個有關(guān)“第二次沖擊”的記事。公元2000年有顆巨大的隕石墜落在南極冰山附近（政府宣稱），高溫造成部分冰塊溶化，連帶使得全球水位上漲，接下來的天災(zāi)人禍更是連綿不斷，公元2015年又出現(xiàn)了新的入侵者，一種似人的巨大機(jī)械戰(zhàn)斗群，人們將之稱為”使徒”，大概是影射他們是上帝派來的使者，要來消滅作惡多端的人類。

人類此刻的各種軍事武器對使徒可說是毫無用處，為此，當(dāng)時地球的政治中心決定重用NERV這個組織，他們以最精密的技術(shù)，花費(fèi)巨資研究出一種以駕駛員的神經(jīng)直接控制的”泛用人形決戰(zhàn)兵器”，這種高科技產(chǎn)物將駕駛員與機(jī)器做了精細(xì)的契合，籍由意志及身體的反映來控制EVA。

不過由于當(dāng)時這些技術(shù)還在研發(fā)階段，所以有許多障礙還無法立即克服。而且因為并不是每個人都能自由的駕駛EVA。駕駛?cè)诉x一直是NERV最頭疼的地方，除了符合條件的人難覓，而且還必須經(jīng)過幾個月訓(xùn)練才能和EVA達(dá)到同步活動的基本能力。而后在世界上發(fā)現(xiàn)了3名可以駕駛EVA的少男少女，人們把希望都寄托在了他們身上。